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Enregistrement W2136116577 · doi:10.1158/1055-9965.epi-10-0909

Common Genetic Variation at <i>BARD1</i> Is Not Associated with Breast Cancer Risk in <i>BRCA1</i> or <i>BRCA2</i> Mutation Carriers

2011· article· en· W2136116577 sur OpenAlexfundno aff
Amanda B. Spurdle, Louise Marquart, Lesley McGuffog, Sue Healey, Olga M. Sinilnikova, Fei Wan, Xiaoqing Chen, Jonathan Beesley, Christian F. Singer, Anne-Catharine Dressler, Daphne Gschwantler‐Kaulich, Joanne L. Blum, Nadine Tung, Jeffrey N. Weitzel, Henry Lynch, Judy Garber, Douglas F. Easton, Susan Peock, Margaret Cook, Clare T Oliver, Debra Frost, Don Conroy, D. Gareth Evans, Fiona Lalloo, Rosalind A. Eeles, Louise Izatt, Rosemarie Davidson, Carol Chu, Diana Eccles, Christina G. Selkirk, Mary Daly, Claudine Isaacs, Dominique Stoppa-Lyonnet, Bruno Buecher, Muriel Belotti, Sylvie Mazoyer, L. Barjhoux, Carole Verny-Pierre, Christine Lasset, Hélène Dreyfus, Pascal Pujol, Marie‐Agnès Collonge‐Rame, Matti A. Rookus, Senno Verhoef, Mieke Kriege, Margreet G.E.M. Ausems, Theo A. van Os, Juul Wijnen, Peter Devilee, Hanne Meijers‐Heijboer, Marinus J. Blok, Tuomas Heikkinen, Heli Nevanlinna, Anna Jakubowska, Jan Lubiński, Tomasz Huzarski, Tomasz Byrski, Francine Durocher, Fergus J. Couch, Noralane M. Lindor, Xianshu Wang, Mads Thomassen, Susan M. Domchek, Maria A. Caligo, Helena Jernström, Annelie Liljegren, Hans Ehrencrona, Per Karlsson, Patricia A. Ganz, Olufunmilayo I. Olopade, Gail E. Tomlinson, Susan L. Neuhausen, Antonis C. Antoniou, Georgia Chenevix‐Trench, Timothy R. Rebbeck

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute for Health and Care ResearchNational Breast Cancer FoundationCanadian Breast Cancer Research AllianceNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthCancer Research UKNational Health and Medical Research CouncilBreast Cancer Research Foundation
Mots-clésBreast cancerMutationOncologyGeneticsMedicineCancerInternal medicineBiologyCancer researchGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Inherited BRCA1 and BRCA2 (BRCA1/2) mutations confer elevated breast cancer risk. Knowledge of factors that can improve breast cancer risk assessment in BRCA1/2 mutation carriers may improve personalized cancer prevention strategies. METHODS: A cohort of 5,546 BRCA1 and 2,865 BRCA2 mutation carriers was used to evaluate risk of breast cancer associated with BARD1 Cys557Ser. In a second nonindependent cohort of 1,537 of BRCA1 and 839 BRCA2 mutation carriers, BARD1 haplotypes were also evaluated. RESULTS: The BARD1 Cys557Ser variant was not significantly associated with risk of breast cancer from single SNP analysis, with a pooled effect estimate of 0.90 (95% CI: 0.71-1.15) in BRCA1 carriers and 0.87 (95% CI: 0.59-1.29) in BRCA2 carriers. Further analysis of haplotypes at BARD1 also revealed no evidence that additional common genetic variation not captured by Cys557Ser was associated with breast cancer risk. CONCLUSION: Evidence to date does not support a role for BARD1 variation, including the Cy557Ser variant, as a modifier of risk in BRCA1/2 mutation carriers. IMPACT: Interactors of BRCA1/2 have been implicated as modifiers of BRCA1/2-associated cancer risk. Our finding that BARD1 does not contribute to this risk modification may focus research on other genes that do modify BRCA1/2-associated cancer risk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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