Integrated multi‐omics analysis supports role of lysophosphatidylcholine and related glycerophospholipids in the<i>Lotus japonicus–Glomus intraradices</i>mycorrhizal symbiosis
Notice bibliographique
Résumé
Interaction of plant roots with arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) is a complex trait resulting in cooperative interactions among the two symbionts including bidirectional exchange of resources. To study arbuscular mycorrhizal symbiosis (AMS) trait variation in the model plant Lotus japonicus, we performed an integrated multi-omics analysis with a focus on plant and fungal phospholipid (PL) metabolism and biological significance of lysophosphatidylcholine (LPC). Our results support the role of LPC as a bioactive compound eliciting cellular and molecular response mechanisms in Lotus. Evidence is provided for large interspecific chemical diversity of LPC species among mycorrhizae with related AMF species. Lipid, gene expression and elemental profiling emphasize the Lotus-Glomus intraradices interaction as distinct from other arbuscular mycorrhizal (AM) interactions. In G. intraradices, genes involved in fatty acid (FA) elongation and biosynthesis of unsaturated FAs were enhanced, while in Lotus, FA synthesis genes were up-regulated during AMS. Furthermore, FAS protein localization to mitochondria suggests FA biosynthesis and elongation may also occur in AMF. Our results suggest the existence of interspecific partitioning of PL resources for generation of LPC and novel candidate bioactive PLs in the Lotus-G. intraradices symbiosis. Moreover, the data advocate research with phylogenetically diverse Glomeromycota species for a broader understanding of the molecular underpinnings of AMS.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».