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Enregistrement W2136237304 · doi:10.1139/w06-010

Molecular characterization of a G protein α-subunit-encoding gene from<i>Mucor circinelloides</i>

2006· article· en· W2136237304 sur OpenAlexvenueno aff
Víctor Meza‐Carmen, Jesús Garcı́a-Soto, Laura Ongay‐Larios, Roberto Coria, Mario Pedraza‐Reyes, José Arnau, Georgina E. Reyna-López, Guadalupe Martínez‐Cadena

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Biology and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversidad de GuanajuatoConsejo Nacional de Ciencia y Tecnología
Mots-clésBiologyMucor circinelloidesMolecular biologyComplementary DNAProtein subunitBiochemistryRecombinant DNAGeneMucorGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genes encoding the Galpha subunit were cloned from Mucor circinelloides, a zygomycete dimorphic fungus. There are at least four genes that encode for Galpha subunits, gpa1, gpa2, gpa3, and gpa4. The genes gpa1 and gpa3 were isolated and characterized, and their predicted products showed 36%-67% identity with Galpha subunits from diverse fungi. Northern blot analysis of gpa3 showed that it is present in spores and constitutively expressed during mycelium development and during yeast-mycelium and mycelium-yeast transitions. However, during yeast cell growth, decreased levels of mRNA were observed. Sequence analysis of gpa3 cDNA revealed that Gpa3 encodes a polypeptide of 356 amino acids with a calculated molecular mass of 40.8 kDa. The deduced sequence of Gpa3 protein contains all the consensus regions of Galpha subunits of the Galpha(i/o/t) subfamily except the cysteine near the C terminus for potential ADP-ribosylation by pertussis toxin. This cDNA was expressed in Escherichia coli and purified by affinity chromatography. Based on its electrophoretic mobility in SDS-PAGE, the molecular mass of the His6-tagged Gpa3 was 45 kDa. The recombinant protein was recognized by a polyclonal antibody against a fragment of a human Galpha(i/o/t). Furthermore, the recombinant Gpa3 was ADP-ribosylated by activated cholera toxin and [32P]NAD but not by pertussis toxin. These results indicate that in M. circinelloides the Galpha subunit Gpa3 is expressed constitutively during differentiation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,317

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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