Subtype‐specific peripheral blood gene expression profiles in recent‐onset juvenile idiopathic arthritis
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To identify differences in peripheral blood gene expression between patients with different subclasses of juvenile idiopathic arthritis (JIA) and healthy controls in a multicenter study of patients with recent-onset JIA prior to treatment with disease-modifying antirheumatic drugs (DMARDs) or biologic agents. METHODS: Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from 59 healthy children and 136 patients with JIA (28 with enthesitis-related arthritis [ERA], 42 with persistent oligoarthritis, 45 with rheumatoid factor [RF]-negative polyarthritis, and 21 with systemic disease) were isolated from whole blood. Poly(A) RNA was labeled using a commercial RNA amplification and labeling system (NuGEN Ovation), and gene expression profiles were obtained using commercial expression microarrays (Affymetrix HG-U133 Plus 2.0). RESULTS: A total of 9,501 differentially expressed probe sets were identified among the JIA subtypes and controls (by analysis of variance; false discovery rate 5%). Specifically, 193, 1,036, 873, and 7,595 probe sets were different in PBMCs from the controls compared with those from the ERA, persistent oligoarthritis, RF-negative polyarthritis, and systemic JIA patients, respectively. In patients with persistent oligoarthritis, RF-negative polyarthritis, and systemic JIA subtypes, up-regulation of genes associated with interleukin-10 (IL-10) signaling was prominent. A hemoglobin cluster was identified that was underexpressed in ERA patients but overexpressed in systemic JIA patients. The influence of JAK/STAT, ERK/MAPK, IL-2, and B cell receptor signaling pathways was evident in patients with persistent oligoarthritis. In systemic JIA, up-regulation of innate immune pathways, including IL-6, Toll-like receptor/IL-1 receptor, and peroxisome proliferator-activated receptor signaling, were noted, along with down-regulation of gene networks related to natural killer cells and T cells. Complement and coagulation pathways were up-regulated in systemic JIA, with a subset of these genes being differentially expressed in other subtypes as well. CONCLUSION: Expression analysis identified differentially expressed genes in PBMCs obtained early in the disease from patients with different subtypes of JIA and in healthy controls, providing evidence of immunobiologic differences between these forms of childhood arthritis.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle