Growth phase-dependent expression of RND efflux pump- and outer membrane porin-encoding genes in Acinetobacter baumannii ATCC 19606
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: To analyse the expression of resistance-nodulation-division (RND) efflux pumps and outer membrane porins during various growth phases of Acinetobacter baumannii ATCC 19606. METHODS: Expression of five different RND pump-encoding genes (adeB, adeG, adeJ, AciBau_2436 and AciBau_2746) and two outer membrane porin-encoding genes (carO and oprD) was analysed at four growth timepoints, representing early, mid and late log phases and the stationary phase using quantitative RT-PCR. RESULTS: The adeB and adeJ RND pump genes were expressed at higher levels than all of the other RND pumps, though their expression was reduced at higher cell density. The adeG gene was found to be constitutively expressed, albeit at much lower levels than those seen for adeB or adeJ. The previously uncharacterized AciBau_2436 was found to be expressed in the early exponential phase. The expression level of oprD was found to be inversely proportional to cell density, while that of carO was found to increase in the mid-log phase but then decrease in the later stages of the growth phase. CONCLUSIONS: This work shows cell density-dependent expression of adeB, adeJ, AciBau_2436, carO and oprD genes, suggesting a role of global regulatory mechanisms in the expression of these genes in A. baumannii ATCC 19606.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».