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Enregistrement W2136306301 · doi:10.1242/jcs.02520

Evidence for the presence of a low-mass β1 integrin on the cell surface

2005· article· en· W2136306301 sur OpenAlexaff
Xiaobo Meng, Keding Cheng, Oleg Krohkin, A. Paul Mould, Martin J. Humphries, Werner Ens, Kenneth G. Standing, John A. Wilkins

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCell Adhesion Molecules Research
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIntegrinBiologyGlycosylationMonoclonal antibodyEpitopeK562 cellsCellCell biologyCell cultureMolecular biologyAntibodyBiochemistryImmunologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although the cell line K562 reportedly expresses a single species of beta1 integrin, alpha5beta1, surface staining with monoclonal antibodies JB1A, 12G10 and B3B11 to the beta1 chain clearly demonstrated differences in the expression levels of the epitopes detected by these antibodies. The present studies were initiated to determine the basis for this molecular heterogeneity in the integrins. Cross-linking of surface integrins with B3B11 caused their selective aggregation. This distribution was similar to that observed for the alpha5 chain. In contrast, cross-linking the beta1 chains with 12G10 did not cause codistribution of alpha5, suggesting that these two species were not associated on the cell surface. Immunoprecipitates of the surface integrins of K562 cells indicated the presence of 120 and 140 kDa forms of the beta1 chain which were detected by 12G10 and B3B11, respectively. Immunological, biochemical and mass spectrometric analysis of K562 surface integrins also failed to demonstrate the presence of any alpha chain in association with the 120 kDa species of beta1 of K562 cells. Treatment of the two forms of beta1 with PGNase reduced their masses to approximately 90 kDa, suggesting that N-glycosylation was responsible for the mass differences. Collectively, these results provide evidence for a novel species of beta1 on the cell surface, which does not appear to be associated with any alpha chain. The data also suggest that differences in glycosylation may be involved in defining the association between the integrin alpha and beta chains and the functional properties of these integrins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,341

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,080
Tête enseignante GPT0,371
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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