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Enregistrement W2136324189 · doi:10.1139/o05-175

Cloning and developmental characterization of <i>Xenopus laevis</i> membrane type-3 matrix metalloproteinase (MT3-MMP)

2006· article· en· W2136324189 sur OpenAlexafffundvenue
Lamis Hammoud, Logan A. Walsh, Sashko Damjanovski

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtease and Inhibitor Mechanisms
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésXenopusMatrix metalloproteinaseBiologyExtracellular matrixCell biologyMolecular biologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Proper extracellular matrix (ECM) remodeling, mediated by matrix metalloproteinases (MMPs), is crucial for the development and survival of multicellular organisms. Full-length Xenopus laevis membrane type-3 matrix metallo proteinase (MT3-MMP) was amplified by PCR and cloned from a stage 28 Xenopus head cDNA library. A comparison of the derived Xenopus MT3-MMP protein sequence to that of other vertebrates revealed 86% identity with human and mouse and 85% identity with chicken. The expression profile of MT3-MMP was examined during Xenopus embryogenesis: MT3-MMP transcripts were first detected at the later stages of development and were localized to dorsal and anterior structures. During metamorphosis and in the adult frog, MT3-MMP expression was restricted to specific tissues and organs. Treatment of Xenopus embryos with lithium chloride (LiCl), ultraviolet irradiation (UV), or retinoic acid (RA) revealed that MT3-MMP levels increased with LiCl-dorsalizing treatments and decreased with UV-ventralizing and RA-anterior neural truncating treatments. Overexpression of MT3-MMP through RNA injections led to dose-dependent developmental abnormalities and death. Moreover, MT3-MMP overexpression resulted in neural and head structure abnormalities, as well as truncated axes. Taken together, these results indicate that MT3-MMP expression in Xenopus is spatially and temporally restricted. Furthermore, deregulation of MT3-MMP during early embryogenesis has detrimental effects on development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2006
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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