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Enregistrement W2136474420 · doi:10.3899/jrheum.090421

Association of Interleukin 23 Receptor Polymorphisms with Anti-Topoisomerase-I Positivity and Pulmonary Hypertension in Systemic Sclerosis

2009· article· en· W2136474420 sur OpenAlexvenueno aff
Sandeep K. Agarwal, Pravitt Gourh, Sanjay Shete, Gene Paz, Dipal Divecha, John D. Reveille, Shervin Assassi, Filemon K. Tan, Maureen D. Mayes, Frank C. Arnett

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Rheumatology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSystemic Sclerosis and Related Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesGeorgia Clinical and Translational Science AllianceScleroderma FoundationCenter for Clinical and Translational Sciences, University of Texas Health Science Center at HoustonNational Institutes of Health
Mots-clésMedicineSNPSingle-nucleotide polymorphismAutoimmune diseaseGenotypeImmunologyInternal medicineIdiopathic pulmonary fibrosisInterstitial lung diseaseGastroenterologyDiseaseGeneGeneticsLungBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: IL23R has been identified as a susceptibility gene for development of multiple autoimmune diseases. We investigated the possible association of IL23R with systemic sclerosis (SSc), an autoimmune disease that leads to the development of cutaneous and visceral fibrosis. METHODS: We tested 9 single-nucleotide polymorphisms (SNP) in IL23R for association with SSc in a cohort of 1402 SSc cases and 1038 controls. IL23R SNP tested were previously identified as SNP showing associations with inflammatory bowel disease. RESULTS: Case-control comparisons revealed no statistically significant differences between patients and healthy controls with any of the IL23R polymorphisms. Analyses of subsets of SSc patients showed that rs11209026 (Arg381Gln variant) was associated with anti-topoisomerase I antibody (ATA)-positive SSc (p = 0.001)) and rs11465804 SNP was associated with diffuse and ATA-positive SSc (p = 0.0001, p = 0.0026, respectively). These associations remained significant after accounting for multiple comparisons using the false discovery rate method. Wild-type genotype at both rs11209026 and rs11465804 showed significant protection against the presence of pulmonary hypertension (PHT). (p = 3x10(-5), p = 1x10(-5), respectively). CONCLUSION: Polymorphisms in IL23R are associated with susceptibility to ATA-positive SSc and protective against development of PHT in patients with SSc.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,260
Score d'incertitude au seuil0,251

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations62
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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