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Enregistrement W2136497233 · doi:10.1093/carcin/bgm127

Histological and proteomic analysis of reversible H-Ras V12G expression in transgenic mouse skin

2007· article· en· W2136497233 sur OpenAlexaff
Wonjun Oh, Vikas Rishi, Steven Pelech, Charles Vinson

Notice bibliographique

RevueCarcinogenesis · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer-related Molecular Pathways
Établissements canadiensKinexus Bioinformatics Corporation (Canada)University of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyKinaseKeratinMolecular biologyEpidermis (zoology)ApoptosisKeratin 5PhosphorylationKeratinocyteTransgeneKeratin 14Cell biologyGenetically modified mousePathologyCell cultureAnatomyMedicineGeneBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have used a two-transgene tetracycline system to reversibly express oncogenic H-Ras(V12G) in mouse skin and primary keratinocytes culture using the bovine keratin 5 promoter. Induction of H-Ras(V12G) expression in skin at 30 days after birth causes epidermal basal cell hyperplasia, an eruption of keratinous cysts and loss of hair follicles by 3 weeks. Subsequent H-Ras(V12G) de-induction for 3 days results in massive apoptosis in the non-H-Ras(V12G)-expressing stroma as well as in the suprabasal cells of the epidermis. Several procaspases such as CASP3, 1alpha, 5 and 12 disappeared, whereas the pro-apoptotic proteins AIF, Bax and Fas ligand were induced in H-Ras(V12G) de-induction skin. This process is followed by a wave of cell division at 14 days as hair follicles regrew, returning to near normal histology and skin appearance by 30 days. Using Kinetworkstrade mark multi-immunoblotting screens, the phosphorylation status of 37 proteins and expression levels of 75 protein kinases in the skin were determined in three samples: (i) wild-type skin, (ii) hyperplastic H-Ras(V12G)-expressing skin and (iii) skin where H-Ras(V12G) expression was suppressed for 7 days. Following H-Ras(V12G) induction, 16 kinases were increased over 2-fold, and 2 kinases were reduced over 50%. This included increased phosphorylation of both known downstream H-Ras(V12G) targets and unknown H-Ras(V12G) targets. After H-Ras(V12G) suppression, many but not all protein changes were reversed. These results from skin and primary keratinocytes are organized to reflect the molecular events that cause the histological changes observed. These proteomic changes identify markers that may mediate the oncogenic addiction paradigm.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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