A complex regulatory network of transcription factors critical for ocular development and disease
Notice bibliographique
Résumé
The PITX2 'homeobox' and FOXC1 and FOXC2 'forkhead box' transcription factors are critical for eye development and cause human ocular diseases when mutated. We have identified biochemical and genetic links between these transcription factors and a transcriptional regulator protein PRKC apoptosis Wilms' tumor 1 regulator (PAWR) that we propose to functionally connect all these proteins in a common pathway critically involved in eye development. We discovered all binary physical interactions between FOXC1, PITX2, FOXC2 and PAWR. Importantly, PAWR modulates the abilities of PITX2, FOXC1 and FOXC2 to activate their genetic targets. Together with either FOXC1 or FOXC2, PAWR increases PITX2 activity. PAWR reduces PITX2 activity in the absence of FOXC1 or FOXC2. At the same time, PAWR also exerts different regulatory effects on different FOXC target sites. Furthermore, morpholino knockdown of pitx2, foxc1 and pawr in zebrafish indicate that PAWR, FOXC1 and PITX2 genetically interact, and are in the same developmental pathway. These data for the first time tie PITX2, FOXC1, FOXC2 and PAWR into a common regulatory pathway. We have therefore identified a functional link between three transcription factors, modulated by PAWR, which we propose underlies the similar ocular phenotypes and glaucoma pathology caused by mutations of these genes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».