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Enregistrement W2136666170 · doi:10.1002/ajmg.a.33308

A rare case of trisomy 15pter‐q21.2 due to a de novo marker chromosome

2010· article· en· W2136666170 sur OpenAlexaff
Ade Nubia Xavier Pacanaro, Denise Maria Christofolini, Leslie Domenici Kulikowski, Síntia Belangero, Fernanda T. Bellucco, Monica Castro Varela, Célia Priszkulnik Koiffmann, Maisa Yoshimoto, Jeremy A. Squire, Adriana V. Schiavon, Benjamin Heck, Maria Isabel Melaragno

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomic variations and chromosomal abnormalities
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo
Mots-clésMarker chromosomeSmall supernumerary marker chromosomeBiologyGeneticsFluorescence in situ hybridizationChromosomal inversionChromosomeSupernumeraryKaryotypeChromosome 15Molecular biologyAnatomyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Supernumerary marker chromosomes (sSMC) may or may not be associated with an abnormal phenotype, depending on the presence of euchromatin, on their chromosomal origin and whether they are inherited. Over 80% of sSMCs are derived from acrocentric chromosomes and half of them include the short arm of chromosome 15. Generally, they appear as bisatellited isodicentric marker chromosomes, most of them are symmetric. These chromosomes are normally originated de novo and are associated with mild to severe intellectual disability but not with physical abnormalities. We report on a patient with an SMC studied using classical and molecular cytogenetic procedures (G and C banding, NOR staining, painting and centromeric fluorescent in situ hybridization (FISH), BAC-FISH, and SKY). The MLPA technique and DNA polymorphic markers were used in order to identify its parental origin. The marker chromosome, monosatellited and monocentric, was found to be derived from a maternal chromosome 15 and was defined as 15pter-q21.2. This is the report of the largest de novo monosatellited 15q marker chromosome ever published presenting detailed cytogenetic and clinical data. It was associated with a phenotype including cardiac defect, absence of septum pellucidum, and dysplasia of the corpus callosum.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,469
Score d'incertitude au seuil0,519

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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Même revueAmerican Journal of Medical Genetics Part AMême sujetGenomic variations and chromosomal abnormalitiesTravaux en français237 207