Screening Citrullinated Proteins in Synovial Tissues of Rheumatoid Arthritis Using 2-dimensional Western Blotting
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: Citrullination, a reaction converting arginine residue into citrulline residue, is essential for autoimmunity of rheumatoid arthritis (RA). We conducted 2-dimensional Western blot analyses (2-D WB) to screen for novel citrullinated proteins in synovial tissues from patients with RA. METHODS: Total proteins were extracted from the synovial membranes of patients with RA (n = 10) and pooled. Four identical 2-D electrophoresis (2-DE) gels were prepared, and 2 gels were transblotted to polyvinylidene fluoride membranes that were separately probed with sera from patients with RA (n = 10) or an anticitrulline antibody. The protein profiles of the 2-DE gels were compared with the hybridization results on a global level. The immunoreactive protein spots were collected from the 2-DE gels and identified using mass spectrometry. Proteins that were detected by both RA sera and anticitrulline antibody were considered citrullinated proteins. The result was confirmed through routine WB, immunoprecipitation, and ELISA. Autoantibodies against these potential antigens were also examined in the blood of patients with RA by ELISA. RESULTS: RA sera and the anticitrulline antibody on 2-D WB detected α-1-antitrypsin (A1AT), dynein heavy-chain 3, fibrinogen β chain, keratin type II cuticular Hb4 (KRT84), lumican, tubulin β-chain (TUBB), and vimentin. A1AT, KRT84, and TUBB had high expression in the synovial membranes (n = 5) of patients with RA and A1AT and KRT84 had high expression in RA synovial fluids (n = 40). A1AT, KRT84, and TUBB immunoprecipitated from synovial tissues showed citrullination. A high level of autoantibodies against KRT84 was detected in the blood of patients with RA (n = 92) compared to that of healthy controls (n = 92). CONCLUSION: Our study identified some new citrullinated proteins in RA synovial tissues using 2-D WB.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».