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Enregistrement W2136756443 · doi:10.1139/v04-131

A solid-state NMR investigation of orexin-B

2004· article· en· W2136756443 sur OpenAlexfundvenueno aff
Guy M. Bernard, Mark Miskolzie, George Kotovych, Roderick E. Wasylishen

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueAdvanced NMR Techniques and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of AlbertaNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsGovernment of Canada
Mots-clésChemistryAmideSolid-state nuclear magnetic resonanceChemical shiftNuclear magnetic resonance spectroscopyResonance (particle physics)CrystallographyMagnetic dipole–dipole interactionStereochemistryDipoleNuclear magnetic resonancePhysical chemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Some key aspects of the secondary structure of solid orexin-B, a 28 amino-acid peptide, have been investigated by solid-state NMR spectroscopy. The 13C–15N dipolar coupling between the carbonyl carbon of Leu11 and the nitrogen of Leu15, as determined by rotational echo double resonance (REDOR) experiments, is 35 Hz, indicating that these nuclei are separated by approximately 4.5 Å. This distance is consistent with the α-helical structure determined for this segment of orexin-B by solution NMR measurements. REDOR measurements of the dipolar coupling between the carbonyl carbon of Ala17 and the nitrogen of Ala22 support the contention in an earlier solution NMR study that a bend exists between the two α helices of orexin-B. However, in the solid state the internuclear distance (6.4 Å) is significantly greater than that observed for orexin-B in aqueous solution. In addition to the distance measurements, the principal components of the amide carbonyl carbon chemical shift (CS) tensors for Leu11 and Ala17 and of the amide nitrogen CS tensors for Leu15 and Ala22 are reported. There are only minor differences between the amide carbonyl carbon CS tensors for Leu11 and Ala17 and between the nitrogen CS tensors for Leu15 and Ala22.Key words: orexin-B, solid-state NMR, REDOR, chemical shift tensors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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