A solid-state NMR investigation of orexin-B
Notice bibliographique
Résumé
Some key aspects of the secondary structure of solid orexin-B, a 28 amino-acid peptide, have been investigated by solid-state NMR spectroscopy. The 13C15N dipolar coupling between the carbonyl carbon of Leu11 and the nitrogen of Leu15, as determined by rotational echo double resonance (REDOR) experiments, is 35 Hz, indicating that these nuclei are separated by approximately 4.5 Å. This distance is consistent with the α-helical structure determined for this segment of orexin-B by solution NMR measurements. REDOR measurements of the dipolar coupling between the carbonyl carbon of Ala17 and the nitrogen of Ala22 support the contention in an earlier solution NMR study that a bend exists between the two α helices of orexin-B. However, in the solid state the internuclear distance (6.4 Å) is significantly greater than that observed for orexin-B in aqueous solution. In addition to the distance measurements, the principal components of the amide carbonyl carbon chemical shift (CS) tensors for Leu11 and Ala17 and of the amide nitrogen CS tensors for Leu15 and Ala22 are reported. There are only minor differences between the amide carbonyl carbon CS tensors for Leu11 and Ala17 and between the nitrogen CS tensors for Leu15 and Ala22.Key words: orexin-B, solid-state NMR, REDOR, chemical shift tensors.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».