Norcoclaurine Synthase Is a Member of the Pathogenesis-Related 10/Bet v1 Protein Family
Notice bibliographique
Résumé
Norcoclaurine synthase (NCS) catalyzes the first committed step in the biosynthesis of benzylisoquinoline alkaloids (BIAs). NCS from Thalictrum flavum (Tf NCS), Papaver somniferum (Ps NCS1 and Ps NCS2), and Coptis japonica (Cj PR10A) share substantial identity with pathogen-related 10 (PR10) and Bet v1 proteins, whose functions are not well understood. A distinct enzyme (Cj NCS1) with similarity to 2-oxoglutarate-dependent dioxygenases was suggested as the bona fide NCS in C. japonica. Here, we validate the exclusive role of PR10/Bet v1-type NCS enzymes in BIA metabolism. Immunolocalization of Ps NCS2 revealed its cell type-specific occurrence in phloem sieve elements, which contain all other known BIA biosynthetic enzymes. In opium poppy, NCS transcripts and proteins were abundant in root and stem, but at low levels in leaf and carpel. Silencing of NCS in opium poppy profoundly reduced alkaloid levels compared with controls. Immunoprecipitation of NCS from total protein extracts of T. flavum cells resulted in a nearly complete attenuation of NCS activity. A Ps NCS2-green fluorescent protein fusion introduced by microprojectile bombardment into opium poppy cells initially localized to the endoplasmic reticulum but subsequently sorted to the vacuole. In our hands, Cj NCS1 did not catalyze the formation of (S)-norcoclaurine from dopamine and 4-hydroxyphenylacetaldehyde.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».