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Enregistrement W2136856112 · doi:10.1002/etc.2469

Use of an avian hepatocyte assay and the avian toxchip polymerse chain reaction array for testing prioritization of 16 organic flame retardants

2013· article· en· W2136856112 sur OpenAlexaff
Emily Porter, Doug Crump, Caroline Egloff, Suzanne Chiu, Sean W. Kennedy

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Toxicology and Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueToxic Organic Pollutants Impact
Établissements canadiensUniversity of OttawaEnvironment and Climate Change Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHepatocyteToxicityCytotoxicityIn vitroChemistryTrisFire retardantCarcinogenBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Risk assessors are challenged with the task of providing data for an increasing number of priority chemicals. High-throughput toxicity screening methods--which permit rapid determination of toxic, molecular, and/or biochemical effects of a wide range of chemicals--are essential to help meet this demand. The avian embryonic hepatocyte in vitro screening method has been utilized in the authors' laboratory to assess the effects of a wide range of environmental contaminants on cytotoxicity and mRNA expression of genes associated with xenobiotic metabolism, the thyroid hormone pathway, lipid metabolism, and growth. Sixteen structurally variable organic flame retardants (OFRs)--including tetrabromoethylcyclohexane (TBECH), tris(2-butoxyethyl) phosphate (TBEP), tricresyl phosphate (TCP), and tris(1,3-dichloro-2-propyl) phosphate (TDCPP)--were screened using the in vitro method in the present study. Hepatocytes from 2 avian species, chicken and herring gull, were prepared, and species differences in hepatocyte viability were observed for several OFRs. For example, TCP was not cytotoxic in chicken hepatocytes up to the highest concentration tested (300 µM), whereas the median lethal concentration (LC50) was 31.2 µM in herring gull hepatocytes. Effects on mRNA expression in chicken embryonic hepatocytes were determined using a 3 × 32 custom-made Avian ToxChip polymerse chain reaction array and were variable among OFRs; TCP, TDCPP, and tris(2,3-dibromopropyl) isocyanurate showed the most significant alterations among the target genes assessed. Overall, this rapid screening method helped prioritize OFRs for further assessment. For example, OFRs that elicited significant effects on cytoxicity or mRNA expression represent prime candidates for egg injection studies that determine adverse effects on the whole animal but are more costly in terms of time, money, and embryo utilization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,230
Score d'incertitude au seuil0,940

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations101
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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