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Enregistrement W2136899763 · doi:10.1017/s1751731111002175

The roles of different porcine cytochrome P450 enzymes and cytochrome b5A in skatole metabolism

2012· article· en· W2136899763 sur OpenAlexaff
P. Wiercinska, Yanping Lou, E. James Squires

Notice bibliographique

Revueanimal · 2012
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSkatoleBoar taintMetaboliteCytochrome P450BiochemistryChemistryCYP2E1MetabolismBiologyIndole testGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Boar taint is the unfavourable odour and taste from pork fat, which results in part from the accumulation of skatole (3-methylindole, 3MI). The key enzymes in skatole metabolism are thought to be cytochrome P450 2E1 (CYP2E1) and cytochrome 2A (CYP2A); however, the cytochrome P450 (CYP450) isoform responsible for the production of the metabolite 6-hydroxy-3-methylindole (6-OH-3MI, 6-hydroxyskatole), which is thought to be involved in the clearance of skatole, has not been established conclusively. The aim of this study was to characterize the role of porcine CYP450s in skatole metabolism by expressing them individually in the human embryonic kidney HEK293-FT cell line. This system eliminates the problems of the lack of specificity of antibodies, inhibitors and substrates for CYP450 isoforms in the pig, and contributions of any other CYP450s that would be present. The results show that pig CYP1A1, CYP2A19, CYP2C33v4, CYP2C49, CYP2E1 and CYP3A and human CYP2E1 (hCYP2E1) are all capable of producing the major skatole metabolite 3-methyloxyindole (3MOI), as well as indole-3-carbinol (I3C), 5-hydroxy-3-methylindole (5-OH-3MI), 6-OH-3MI, 2-aminoacetophenone (2AAP) and 3-hydroxy-3-methyloxindole. CYP2A19 produced the highest amount of the physiologically important metabolite 6-OH-3MI, followed by porcine CYP2E1 and CYP2C49; CYP2A19 also produced more 6-OH-3MI than hCYP2E1. Co-transfection with CYB5A increased the production of skatole metabolites by some of the CYP450s, suggesting that CYB5A plays an important role in the metabolism of skatole. We also show the utility of this expression system to check the specificity of selected substrates and antibodies for porcine CYP450s. Further information regarding the abundance of different CYP450 isoforms is required to fully understand their contribution to skatole metabolism in vivo in the pig.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,618
Score d'incertitude au seuil0,785

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,396
Écart entre enseignants0,337 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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