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Enregistrement W2136902126 · doi:10.1093/carcin/bgt004

Identification of common variants in BRCA2 and MAP2K4 for susceptibility to sporadic pancreatic cancer

2013· article· en· W2136902126 sur OpenAlexaff
Liming Huang, Chen Wu, Dianke Yu, C. Wang, Xin Che, Xiaoping Miao, K. Zhai, J. Chang, Guoliang Jiang, Xiaoguang Yang, Guangwen Cao, Hu Zhou, Yifeng Zhou, Changjing Zuo, Xi Zhang, Xianjun Yu, Wei Dai, Zhenhui Li, Hongyu Shen, L. Liu, Yong Chen, Sining Zhang, X. Wang, Yi Liu, Menghong Sun, WuQiang Cao, Jun Gao, Yanan Ma, Xiao Zheng, ST Cheung, Yongfeng Jia, Wen Tan, Tingting Wu, Dongxin Lin

Notice bibliographique

RevueCarcinogenesis · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic and Hepatic Oncology Research
Établissements canadiensPancreas Centre (Canada)
Organismes subventionnairesNational High-tech Research and Development ProgramNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésPancreatic cancerOdds ratioGenetic predispositionCancerInternal medicinePancreatic diseaseBiologyGeneticsMedicinePancreasOncologyGastroenterologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Germline mutations in genes that cause hereditary syndromes are highly predisposed to familial pancreatic cancer. However, genetic susceptibility to sporadic pancreatic cancer is largely uncovered. We conducted a two-stage association study on pancreatic cancer that included 981 cases and 1991 controls in the first stage followed by a second stage (2603 cases and 2877 controls). Using an approach based on candidate genes whose roles in pancreatic cancer have been well known, we identified two new susceptibility loci. rs11571836 located in the BRCA2 3'-untranslated region was significantly associated with lower expression of BRCA2 transcript and increased pancreatic cancer risk [odds ratio = 1.30, 95% confidence interval = 1.14-1.47, P = 7.64 × 10(-5)] in a recessive manner. rs12939944 located in the MAP2K4 intron was associated with decreased risk (odds ratio = 0.82, 95% confidence interval = 0.74-0.91, P = 0.0001) in a dominant manner. Our results demonstrate for the first time that common variants in BRCA2 and MAP2K4 are susceptibility to sporadic pancreatic cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,106
Score d'incertitude au seuil0,503

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,350
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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