Identification of common variants in BRCA2 and MAP2K4 for susceptibility to sporadic pancreatic cancer
Notice bibliographique
Résumé
Germline mutations in genes that cause hereditary syndromes are highly predisposed to familial pancreatic cancer. However, genetic susceptibility to sporadic pancreatic cancer is largely uncovered. We conducted a two-stage association study on pancreatic cancer that included 981 cases and 1991 controls in the first stage followed by a second stage (2603 cases and 2877 controls). Using an approach based on candidate genes whose roles in pancreatic cancer have been well known, we identified two new susceptibility loci. rs11571836 located in the BRCA2 3'-untranslated region was significantly associated with lower expression of BRCA2 transcript and increased pancreatic cancer risk [odds ratio = 1.30, 95% confidence interval = 1.14-1.47, P = 7.64 × 10(-5)] in a recessive manner. rs12939944 located in the MAP2K4 intron was associated with decreased risk (odds ratio = 0.82, 95% confidence interval = 0.74-0.91, P = 0.0001) in a dominant manner. Our results demonstrate for the first time that common variants in BRCA2 and MAP2K4 are susceptibility to sporadic pancreatic cancer.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».