Isolation of Differentially Expressed Genes in Conceptuses and Endometrial Tissue of Sows in Early Gestation1
Notice bibliographique
Résumé
The implantation period is a critical time for embryonic survival in pigs. During this period, numerous growth factors are secreted by the conceptuses and the uterine endometrium in order to establish pregnancy and to provide a proper environment for embryonic development. It is well known that the Chinese Meishan sows have a larger litter size when compared with occidental sows mainly because of a superior embryonic survival rate. As a further step toward understanding the mechanisms involved in embryonic survival, we used a suppression subtractive hybridization technique to identify genes that were differentially expressed in Meishan-Landrace conceptuses and endometrial tissue at Day 15 of gestation when compared with conventional Landrace sows. Of the 1000 subtractive clones isolated from each library, 137 endometrial and 166 conceptus-enriched cDNAs were single-pass sequenced and examined by BLAST analysis for identification. Sixty-two percent of the clones found in the endometrial library and 78% of the clones found in the conceptus library showed homology with known genes. Among these genes, the 20 most relevant to embryonic survival based on the available literature were validated through real-time reverse-transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) analysis. Our results show that suppression subtractive hybridization is a powerful method applicable in identifying putative candidate genes that might be used for selection of high litter-size breeds.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».