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Enregistrement W2136943416 · doi:10.1136/jmg.40.11.e126

Identification of eight novel <i>NSD1</i> mutations in Sotos syndrome

2003· article· en· W2136943416 sur OpenAlexaff
Junichi Kamimura

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Syndromes and Imprinting
Établissements canadiensAlberta HealthUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCore Research for Evolutional Science and TechnologyJapan Science and Technology CorporationUniversità degli Studi di SienaFriedrich-Schiller-Universität Jena
Mots-clésSotos syndromeHaploinsufficiencyFrontal BossingGigantismGeneticsExonPituitary disorderPoint mutationBiologyCraniofacialMutationMedicineGeneEndocrinologyAnatomyPhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sotos syndrome or cerebral gigantism (SoS, OMIM #117550) is a well-known disorder characterised by overgrowth with advanced bone age, craniofacial anomalies, developmental delay, and occasional seizures.1,2 A typical face has a large head circumference, frontal bossing with high anterior hairline, down slanting of palpebral fissures, flat nasal bridge, and prominent jaw.3 The hands and feet are usually large. Height and weight tends to normalise in adulthood.4 EEG abnormalities, hypotonia, strabismus, congenital heart defects, kyphoscoliosis, and cancer have also been noted.3,5–10 Since the original report in 1964,1 more than 300 affected cases have been reported. Most cases are sporadic, while several familial cases have been described, suggesting that SoS is an autosomal dominant disorder.8,11–17 We have previously isolated the nuclear receptor SET domain containing gene 1 ( NSD1 ) from the 5q35 translocation breakpoint in a Japanese SoS patient with t(5;8)(q35; q24.1).18,19 NSD1 encodes 2696 amino acids (GenBank accession no. AF395588), and the gene has several putative functional domains, such as NID−L, NID+L, SET, SAC, PWWP-I, PWWWP-II, PHD-I, PHD-II, and PHD-III, suggesting that the NSD1 protein may be associated with chromatin mediated transcriptional regulation.19–24 In 42 Japanese sporadic cases of SoS, we identified 20 submicroscopic deletions including the entire NSD1 gene and four point mutations, the data indicating that SoS is caused by haploinsufficiency of NSD1 .25 Recently, a UK group reported 29 novel NSD1 point mutations and only three microdeletions in 37 typical SoS and 13 SoS-like patients, and suggested that NSD1 intragenic mutations instead of microdeletions were the major cause of SoS.26 In this study, we validated the spectrum of NSD1 intragenic mutations among 30 newly collected SoS patients. The subjects studied included 13 Japanese and 17 non-Japanese patients with …

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,148
Score d'incertitude au seuil0,341

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations35
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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