Proteomic Analysis of Pharmacological Preconditioning
Notice bibliographique
Résumé
Ischemic preconditioning is characterized by resistance to ischemia reperfusion injury in response to previous short ischemic episodes, a protective effect that can be mimicked pharmacologically. The underlying mechanism of protection remains controversial and requires greater understanding before it can be fully exploited therapeutically. To investigate the overall effect of preconditioning on the myocardial proteome, isolated rabbit ventricular myocytes were treated with drugs known to induce preconditioning, adenosine or diazoxide (each at 100 micromol/L for 60 minutes). Their protein profiles were then compared with vehicle-treated controls (n=4 animals per treatment) using a multitiered 2D gel electrophoresis approach. Of 28 significantly altered protein spots, 19 nonredundant proteins were identified (5 spots remained unidentified). The majority of these proteins are involved in mitochondrial energetics, including subunits of tricarboxylic acid cycle enzymes and oxidative phosphorylation complexes. These changes were not indiscriminate, with only a small number of enzymes or complex subunits altered, indicating a very specific and targeted affect of these 2 preconditioning mimetics. Among the changes were shifts in the extent of posttranslational modification of 4 proteins. One of these, the adenosine-induced phosphorylation of the ATP synthase beta subunit, was fully characterized with the identification of 5 novel phosphorylation sites. This proteomics approach provides an overall assessment of the cellular response to pharmacological treatment with adenosine and diazoxide and identifies a distinct subset of enzymes and protein complex subunit that may underlie the preconditioned phenotype.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».