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Enregistrement W2136998576 · doi:10.1590/s1516-05722014000200008

Characterization of diversity and genetic structure in natural populations of Stryphnodendron adstringens (Mart.) Coville by means of allozyme markers

2014· article· en· W2136998576 sur OpenAlexfundno aff
Jaqueline Siqueira Glasenapp, Erika Ramos Martins, Vicente Wagner Dias Casali, Cosme Damião Cruz, Priscila Barros Barbosa

Notice bibliographique

RevueRevista Brasileira de Plantas Medicinais · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePhytochemistry Medicinal Plant Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesPartenariat Canadien Contre Le CancerFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas GeraisUniversidade Federal de Minas GeraisConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico
Mots-clésUPGMAFixation indexGenetic diversityBiologyPopulationLocus (genetics)Genetic distanceGenetic variationAlleleGenetic structureGeneticsDemographyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The S. adstringens, a typical Cerrado (Brazilian savannah) tree, is used because of its medicinal and tanning properties. Because of the still incipient genetic knowledge of the species, the objective of this work was to characterize the diversity and genetic structure of S. adstringens by using allozyme markers. Seeds were collected in five Brazilian mesoregions, in which 627 individuals in 16 populations in the states of Minas Gerais and Goiás were sampled. Fourteen isoenzyme systems were assessed, out of which seven were polymorphic with a total of 10 loci and 28 alleles. Average genetic diversity (H) was 0.226, average proportion of polymorphic loci (P) was 68.75, average number of alleles per polymorphic locus (AP) was 2.65 and effective number of alleles (Ae) was equal to 1.29. The results of total fixation index (F= 0.003), within population fixation index (f =-0.114) and genetic differentiation measure (θ =0.105) were not significant, which shows the inexistence of genetic structure. Two principal groups were found in the cluster analysis (UPGMA), where the first one was formed by the population of State Park (PE) of Rio Preto (MG) and the other, by the other populations. If the population of PE of Rio Preto is excluded from the analysis, G ST is drastically reduced from 0.077 to 0.026. Thus, approximately 2/3 of the total value of G ST found in S. adstringens was due to the variation among the population of PE of Rio Preto and the other populations. Overall, the values of H and P found in S. adstringens are compatible with the ones found in typically distributed tropical trees. On the other hand, by excluding the population of PE of Rio Preto, the value of the G ST genetic differentiation measure was smaller than the one found in native tropical trees from temperate zones. The similarity between the assessed populations shows that the gene flow is still high enough to avoid genetic differentiation, at the local level, at least.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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