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Enregistrement W2137009674 · doi:10.3389/fpls.2012.00143

ER Import Sites and Their Relationship to ER Exit Sites: A New Model for Bidirectional ER-Golgi Transport in Higher Plants

2012· article· en· W2137009674 sur OpenAlexfundno aff
Alexander Lerich, Stefan Hillmer, Markus Langhans, David Scheuring, Paulien van Bentum, David G. Robinson

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Plant Science · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCentre National de la Recherche ScientifiqueEberhard Karls Universität TübingenUniversität HeidelbergAgriculture and Agri-Food CanadaUniversité de StrasbourgDeutsche ForschungsgemeinschaftU.S. Department of Energy
Mots-clésCOPIIGolgi apparatusCOPIColocalizationCell biologyEndoplasmic reticulumFluorescence recovery after photobleachingBiologyNocodazoleYellow fluorescent proteinMicrotubuleSecretory pathwayChemistryBiochemistryCellGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Per definition, ER exit sites are COPII vesiculation events at the surface of the ER and in higher plants are only visualizable in the electron microscope through cryofixation techniques. Fluorescent COPII labeling moves with Golgi stacks and locates to the interface between the ER and the Golgi. In contrast, the domain of the ER where retrograde COPI vesicles fuse, i.e., ER import sites (ERIS), has remained unclear. To identify ERIS we have employed ER-located SNAREs and tethering factors. We screened several SNAREs (SYP81, the SYP7 family, and USE1) to find a SNARE whose overexpression did not disrupt ER-Golgi traffic and which gave rise to discrete fluorescent punctae when expressed with an XFP tag. Only the Qc-SNARE SYP72 fulfilled these criteria. When coexpressed with SYP72-YFP, both the type I-membrane protein RFP-p24δ5 and the luminal marker CFP-HDEL whose ER localization are due to an efficient COPI-mediated recycling, form nodules along the tubular ER network. SYP72-YFP colocalizes with these nodules which are not seen when RFP-p24δ5 or CFP-HDEL is expressed alone or when SYP72-YFP is coexpressed with a mutant form of RFP-p24δ5 that cannot exit the ER. SYP72-YFP does not colocalize with Golgi markers, except when the Golgi stacks are immobilized through actin depolymerization. Endogenous SYP7 SNAREs, also colocalize with immobilized COPII/Golgi. In contrast, XFP-tagged versions of plant homologs to TIP20 of the Dsl1 COPI-tethering factor complex, and the COPII-tethering factor p115 colocalize perfectly with Golgi stacks irrespective of the motile status. These data suggest that COPI vesicle fusion with the ER is restricted to periods when Golgi stacks are stationary, but that when moving both COPII and COPI vesicles are tethered and collect in the ER-Golgi interface. Thus, the Golgi stack and an associated domain of the ER thereby constitute a mobile secretory and recycling unit: a unique feature in eukaryotic cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,129
Score d'incertitude au seuil0,457

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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