MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2137116499 · doi:10.1101/lm.500907

Histone modifications around individual BDNF gene promoters in prefrontal cortex are associated with extinction of conditioned fear

2007· article· en· W2137116499 sur OpenAlexfundno aff
Timothy W. Bredy, Hao Wu, Cortney Crego, Jessica Zellhoefer, Yi Eve Sun, Mark Barad

Notice bibliographique

RevueLearning & Memory · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurogenesis and neuroplasticity mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésEpigeneticsNeuroscienceNeurotrophic factorsHistone deacetylasePsychologyExtinction (optical mineralogy)Brain-derived neurotrophic factorHistonePrefrontal cortexBiologyGeneticsGeneCognition

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Extinction of conditioned fear is an important model both of inhibitory learning and of behavior therapy for human anxiety disorders. Like other forms of learning, extinction learning is long-lasting and depends on regulated gene expression. Epigenetic mechanisms make an important contribution to persistent changes in gene expression; therefore, in these studies, we have investigated whether epigenetic regulation of gene expression contributes to fear extinction. Since brain-derived neurotrophic factor (BDNF) is crucial for synaptic plasticity and for the maintenance of long-term memory, we examined histone modifications around two BDNF gene promoters after extinction of cued fear, as potential targets of learning-induced epigenetic regulation of gene expression. Valproic acid (VPA), used for some time as an anticonvulsant and a mood stabilizer, modulates the expression of BDNF, and is a histone deacetylase (HDAC) inhibitor. Here, we report that extinction of conditioned fear is accompanied by a significant increase in histone H4 acetylation around the BDNF P4 gene promoter and increases in BDNF exon I and IV mRNA expression in prefrontal cortex, that VPA enhances long-term memory for extinction because of its HDAC inhibitor effects, and that VPA potentiates the effect of weak extinction training on histone H4 acetylation around both the BDNF P1 and P4 gene promoters and on BDNF exon IV mRNA expression. These results suggest a relationship between histone H4 modification, epigenetic regulation of BDNF gene expression, and long-term memory for extinction of conditioned fear. In addition, they suggest that HDAC inhibitors may become a useful pharmacological adjunct to psychotherapy for human anxiety disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations549
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueLearning & MemoryMême sujetNeurogenesis and neuroplasticity mechanismsTravaux en français237 207