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Enregistrement W2137207006 · doi:10.1183/09031936.00040307

Association of genetic variations in the<i>CSF2</i>and<i>CSF3</i>genes with lung function in smoking-induced COPD

2008· article· en· W2137207006 sur OpenAlexafffund
Jian‐Qing He, Karey Shumansky, John E. Connett, Nicholas R. Anthonisen, Peter D. Paré, ANDREW J. SANDFORD

Notice bibliographique

RevueEuropean Respiratory Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD) Research
Établissements canadiensUniversity of ManitobaUniversity of British ColumbiaSt. Paul's Hospital
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismHaplotypeOdds ratioCOPDMedicineImmunologyAlleleSNPInternal medicineGenetic associationLungGenotypeGeneticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor (CSF), also known as CSF2, and granulocyte CSF, also known as CSF3, are important survival and proliferation factors for neutrophils and macrophages. The objective of the present study was to determine whether single nucleotide polymorphisms (SNPs) of CSF2 and CSF3 are associated with lung function in smoking-induced chronic obstructive pulmonary disease. In total, five SNPs of CSF2 and CSF3 were studied in 587 non-Hispanic white subjects with the fastest (n = 281) or the slowest (n = 306) decline of lung function selected from among continuous smokers in the National Heart, Lung, and Blood Institute Lung Health Study (LHS). These SNPs were also studied in 1,074 non-Hispanic white subjects with the lowest (n = 536) or the highest (n = 538) baseline lung function at the beginning of the LHS. An increase in the number of CSF3 -1719T alleles was significantly associated with protection against low lung function (odds ratio 0.73, 95% confidence interval 0.56-0.95), and was still significant after adjustment for multiple comparisons. There was also a significant association of a CSF3 haplotype with baseline levels of forced expiratory volume in one second. No association was found for CSF2 SNPs and lung function, nor was there evidence of epistasis. In conclusion, genetic variation in colony-stimulating factor 3 is associated with cross-sectionally measured lung function in smokers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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