The ribosomal RNA gene promoter and adjacent cis-acting DNA sequences govern plasmid DNA partitioning and stable inheritance in the parasitic protozoan Leishmania
Notice bibliographique
Résumé
Detailed analysis of the Leishmania donovani ribosomal RNA (rRNA) gene promoter region has allowed the identification of cis-acting sequences involved in plasmid DNA partitioning and stable plasmid inheritance. We report that plasmids bearing the 350 bp rRNA promoter along with the 200 bp region immediately 3' to the promoter exhibited a 6.5-fold increase in transformation frequency and were transmitted to daughter cells as single-copy molecules. This is in contrast to what has been observed for plasmid molecules in this organism so far. Moreover, we show that these low-copy-number plasmids displayed a remarkable mitotic stability in the absence of selective pressure. The region in the vicinity of the RNA pol I transcription initiation site, and also in the adjacent 200 nt, displays a complex structural organization and shares sequence similarity to the yeast autonomously replicating consensus sequence and centromere DNA elements. Deletion analyses indicated that these elements were necessary but not sufficient for plasmid DNA partitioning and stable inheritance, and that the rRNA promoter region was required for optimal function. These results suggest an interplay between RNA pol I transcription, DNA replication, DNA partitioning and mitotic stability in trypanosomatids. This is the first example of defined DNA elements for plasmid partitioning and stable inheritance in the protozoan parasite Leishmania.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».