Evidence That the Large Noncoding Sequence Is the Main Control Region of Maternally and Paternally Transmitted Mitochondrial Genomes of the Marine Mussel (Mytilus spp.)
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Both the maternal (F-type) and paternal (M-type) mitochondrial genomes of the Mytilus species complex M. edulis/galloprovincialis contain a noncoding sequence between the l-rRNA and the tRNA(Tyr) genes, here called the large unassigned region (LUR). The LUR, which is shorter in M genomes, is capable of forming secondary structures and contains motifs of significant sequence similarity with elements known to have specific functions in the sea urchin and the mammalian control region. Such features are not present in other noncoding regions of the F or M Mytilus mtDNA. The LUR can be divided on the basis of indels and nucleotide variation in three domains, which is reminiscent of the tripartite structure of the mammalian control region. These features suggest that the LUR is the main control region of the Mytilus mitochondrial genome. The middle domain has diverged by only 1.5% between F and M genomes, while the average divergence over the whole molecule is approximately 20%. In contrast, the first domain is among the most divergent parts of the genome. This suggests that different parts of the LUR are under different selection constraints that are also different from those acting on the coding parts of the molecule.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle