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Enregistrement W2137307574 · doi:10.1073/pnas.1424400112

Mutant <i>IDH</i> is sufficient to initiate enchondromatosis in mice

2015· article· en· W2137307574 sur OpenAlexafffund
Makoto Hirata, Masato Sasaki, Rob A. Cairns, Satoshi Inoue, Vijitha Puviindran, Wanda Y. Li, Bryan E. Snow, Lisa D. Jones, Qingxia Wei, Shingo Sato, Yuning J. Tang, Puviindran Nadesan, Jason S. Rockel, Heather Whetstone, Raymond Poon, Angela Weng, Stefan Größ, Kimberly Straley, Camelia Gliser, YingXia Xu, Jay S. Wunder, Tak W. Mak, Benjamin A. Alman

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone Tumor Diagnosis and Treatments
Établissements canadiensMount Sinai HospitalUniversity Health NetworkOntario Institute for Cancer ResearchHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchGovernment of Canada
Mots-clésIsocitrate dehydrogenaseMutantIDH1CartilageCarcinogenesisMutationBiologyEnchondromaCancer researchMolecular biologyGeneGeneticsEnzymePathologyChondrosarcomaAnatomyMedicineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Enchondromas are benign cartilage tumors and precursors to malignant chondrosarcomas. Somatic mutations in the isocitrate dehydrogenase genes (IDH1 and IDH2) are present in the majority of these tumor types. How these mutations cause enchondromas is unclear. Here, we identified the spectrum of IDH mutations in human enchondromas and chondrosarcomas and studied their effects in mice. A broad range of mutations was identified, including the previously unreported IDH1-R132Q mutation. These mutations harbored enzymatic activity to catalyze α-ketoglutarate to d-2-hydroxyglutarate (d-2HG). Mice expressing Idh1-R132Q in one allele in cells expressing type 2 collagen showed a disordered growth plate, with persistence of type X-expressing chondrocytes. Chondrocyte cell cultures from these animals or controls showed that there was an increase in proliferation and expression of genes characteristic of hypertrophic chondrocytes with expression of Idh1-R132Q or 2HG treatment. Col2a1-Cre;Idh1-R132Q mutant knock-in mice (mutant allele expressed in chondrocytes) did not survive after the neonatal stage. Col2a1-Cre/ERT2;Idh1-R132 mutant conditional knock-in mice, in which Cre was induced by tamoxifen after weaning, developed multiple enchondroma-like lesions. Taken together, these data show that mutant IDH or d-2HG causes persistence of chondrocytes, giving rise to rests of growth-plate cells that persist in the bone as enchondromas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,077
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations119
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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