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Enregistrement W2137545559 · doi:10.1091/mbc.e10-04-0305

The QKI-6 RNA Binding Protein Regulates Actin-interacting Protein-1 mRNA Stability during Oligodendrocyte Differentiation

2010· article· en· W2137545559 sur OpenAlexafffund
Evgueni Doukhanine, Christina Gavino, Jeffery D. Haines, Guillermina Almazán, Stéphane Richard

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology of the Cell · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesMultiple Sclerosis SocietyMultiple Sclerosis Society of Canada
Mots-clésBiologyRNA-binding proteinMessenger RNAOligodendrocyteRNAMolecular biologyCell biologyCellular differentiationUntranslated regionCytoplasmMyelinGeneGeneticsCentral nervous system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The quaking viable (qk(v)) mice represent an animal model of dysmyelination. The absence of expression of the QKI-6 and QKI-7 cytoplasmic isoforms in oligodendrocytes (OLs) during CNS myelination causes the qk(v) mouse phenotype. The QKI RNA-binding proteins are known to regulate RNA metabolism of cell cycle proteins and myelin components in OLs; however, little is known of their role in reorganizing the cytoskeleton or process outgrowth during OL maturation and differentiation. Here, we identify the actin-interacting protein (AIP)-1 mRNA as a target of QKI-6 by using two-dimensional differential gel electrophoresis. The AIP-1 mRNA contains a consensus QKI response element within its 3'-untranslated region that, when bound by QKI-6, decreases the half-life of the AIP-1 mRNA. Although the expression of QKI-6 is known to increase during OL differentiation and CNS myelination, we show that this increase is paralleled with a corresponding decrease in AIP-1 expression in rat brains. Furthermore, qk(v)/qk(v) mice that lack QKI-6 and QKI-7 within its OLs had an increased level of AIP-1 in OLs. Moreover, primary rat OL precursors harboring an AIP-1 small interfering RNA display defects in OL process outgrowth. Our findings suggest that the QKI RNA-binding proteins regulate OL differentiation by modulating the expression of AIP-1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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