Molecular phylogenetics and taxonomy of leaf-toed geckos (Phyllodactylidae: Phyllodactylus) inhabiting the peninsula of Baja California
Notice bibliographique
Résumé
Herein we assess the phylogenetic relationships and taxonomy of geckos of the genus Phyllodactylus inhabiting the peninsula of Baja California, Mexico using five mitochondrial and two nuclear genes. Phylogenetic analysis using maximum parsimony (MP) and Bayesian inference (BI) recovered three distinct peninsular clades with high statistical support. Sequence divergence estimates between peninsular taxa approached 13%. Two of the species, P. unctus and P. xanti are Cape Region endemics, whereas P. nocticolus is widespread throughout much of the peninsula and extreme southern California. Monophyly of the peninsular taxa was strongly supported. In the MP analysis, P. unctus rooted at the base of the peninsular clade, resolving P. xanti and P. nocticolus as sister taxa. Conversely, BI placed P. nocticolus and P. unctus as sister taxa. These data provide further evidence for a trans-peninsular seaway near the Isthmus of La Paz, severing the Cape Region from the rest of the peninsula. The analysis also supports the validity of P. nocticolus as a distinct species and suggests a single invasion to the peninsula from mainland Mexico, presumably during tectonic activity during the Miocene.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».