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Enregistrement W2137678498 · doi:10.1016/j.crci.2008.06.020

Physical mechanisms of bacterial survival revealed by combined grazing-incidence X-ray scattering and Monte Carlo simulation

2008· article· en· W2137678498 sur OpenAlex
Rafael G. Oliveira, Emanuel Schneck, Bonnie Quinn, Oleg Konovalov, Klaus Brandenburg, Ulrich Seydel, Tom Gill, Charles B. Hanna, David A. Pink, Motomu Tanaka

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueComptes Rendus Chimie · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensDalhousie UniversitySt. Francis Xavier University
Organismes subventionnairesEuropean Synchrotron Radiation Facility
Mots-clésMonte Carlo methodScatteringIncidence (geometry)GrazingStatistical physicsPhysicsDynamic Monte Carlo methodComputational physicsOpticsBiologyMathematicsStatisticsEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The combination of grazing-incidence X-ray scattering experiments and Monte Carlo simulation unravels the physics of bacterial survival against cationic antimicrobial peptides (protamine). As a realistic model of bacterial outer membranes, an insoluble monolayer of lipopolysaccharide from Salmonella enterica sv. Minnesota Ra (LPS Ra) is spread on buffered subphase. In the presence of Ca 2+ , vertical electron density profiles reconstructed from X-ray scattering imply the “collapse” of saccharide chains, suggesting that Ca 2+ bridges the negatively charged saccharide units. Under this condition, the LPS monolayer remains intact even after injection of protamine near the minimum inhibitory concentration. This can theoretically be accounted in terms of the formation of an electrostatic energy barrier that prevents the approach of protamine to the hydrophobic region. In contrast, as predicted from in vivo experiments, the intrusion of protamine in the absence of Ca 2+ results in the complete destruction of the layered structure of LPS Ra monolayers.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,072
Score d'incertitude au seuil0,749

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle