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Enregistrement W2137685927 · doi:10.1091/mbc.e08-03-0282

The SM Protein Car/Vps33A Regulates SNARE-mediated Trafficking to Lysosomes and Lysosome-related Organelles

2009· article· en· W2137685927 sur OpenAlexfundno aff
Mohammed Akbar, Sanchali Ray, Helmut Krämer

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology of the Cell · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Eye InstituteNational Institutes of HealthBoston CollegeHospital for Sick ChildrenWelch Foundation
Mots-clésEndosomeBiologyCell biologyLysosomeGolgi apparatusLipid bilayer fusionOrganelleSyntaxinMembrane proteinGeneticsBiochemistryMembraneEndoplasmic reticulum

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The SM proteins Vps33A and Vps33B are believed to act in membrane fusions in endosomal pathways, but their specific roles are controversial. In Drosophila, Vps33A is the product of the carnation (car) gene. We generated a null allele of car to test its requirement for trafficking to different organelles. Complete loss of car function is lethal during larval development. Eye-specific loss of Car causes late, light-independent degeneration of photoreceptor cells. Earlier in these cells, two distinct phenotypes were detected. In young adults, autophagosomes amassed indicating that their fusion with lysosomes requires Car. In eye discs, endocytosed receptors and ligands accumulate in Rab7-positive prelysosomal compartments. The requirement of Car for late endosome-to-lysosome fusion in imaginal discs is specific as early endosomes are unaffected. Furthermore, lysosomal delivery is not restored by expression of dVps33B. This specificity reflects the distinct pattern of binding to different Syntaxins in vitro: dVps33B predominantly binds the early endosomal Avl and Car to dSyntaxin16. Consistent with a role in Car-mediated fusion, dSyntaxin16 is not restricted to Golgi membranes but also present on lysosomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,584

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations88
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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