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Enregistrement W2137737168 · doi:10.1371/journal.pone.0003614

AMP-Activated Protein Kinase-Regulated Activation of the PGC-1α Promoter in Skeletal Muscle Cells

2008· article· en· W2137737168 sur OpenAlexafffund
Isabella Irrcher, Vladimir Ljubicic, Angie F. Kirwan, David A. Hood

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésSkeletal muscleCell biologyAMP-activated protein kinaseChemistryProtein kinase AKinaseBiologyAMPKAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mechanisms by which PGC-1alpha gene expression is controlled in skeletal muscle remains largely undefined. Thus, we sought to investigate the transcriptional regulation of PGC-1alpha using AICAR, an activator of AMPK, that is known to increase PGC-1alpha expression. A 2.2 kb fragment of the human PGC-1alpha promoter was cloned and sequence analysis revealed that this TATA-less sequence houses putative consensus sites including a GC-box, a CRE, several IRSs, a SRE, binding sites for GATA, MEF2, p 53, NF-kappaB, and EBox binding proteins. AMPK activation for 24 hours increased PGC-1alpha promoter activity with concomitant increases in mRNA expression. The effect of AICAR on transcriptional activation was mediated by an overlapping GATA/EBox binding site at -495 within the PGC-1alpha promoter based on gel shift analyses that revealed increases in GATA/EBox DNA binding. Mutation of the EBox within the GATA/EBox binding site in the promoter reduced basal promoter activity and completely abolished the AICAR effect. Supershift analyses identified USF-1 as a DNA binding transcription factor potentially involved in regulating PGC-1alpha promoter activity, which was confirmed in vivo by ChIP. Overexpression of either GATA-4 or USF-1 alone increased the p851 PGC-1alpha promoter activity by 1.7- and 2.0-fold respectively, while co-expression of GATA-4 and USF-1 led to an additive increase in PGC-1alpha promoter activity. The USF-1-mediated increase in PGC-1alpha promoter activation led to similar increases at the mRNA level. Our data identify a novel AMPK-mediated regulatory pathway that regulates PGC-1alpha gene expression. This could represent a potential therapeutic target to control PGC-1alpha expression in skeletal muscle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,103
Score d'incertitude au seuil0,371

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations210
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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