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Enregistrement W2137785496 · doi:10.1039/c0em00366b

Performance evaluation of phycocyanin probes for the monitoring of cyanobacteria

2010· article· en· W2137785496 sur OpenAlexaff
Christian Bastien, Richard Cardin, Éloïse Veilleux, Christian Deblois, Annabelle M Warren, Isabelle Laurion

Notice bibliographique

RevueJournal of Environmental Monitoring · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAquatic Ecosystems and Phytoplankton Dynamics
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche ScientifiqueInstitut de Recherche et de Développement en Agroenvironnement
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhycocyaninCyanobacteriaEnvironmental chemistryEnvironmental scienceChemistryBiologyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The performance of two field probes (YSI 6600 and TriOS), used for the measurement of in vivo phycocyanin fluorescence, was compared and validated in the laboratory in 2008 and 2009 with cultures of Microcystis aeruginosa and field samples. The background noise of the two probes was low and the detection limits were estimated at 1500 cells mL(-1) for the YSI and 0.69 µg PC L(-1) for the TriOS. The linearity and repeatability of both probes have been excellent. Strong relationships were observed between the in vivo fluorescence and the total cyanobacterial biovolume (R(2) = 0.82 YSI; 0.83 TriOS) or the abundance (R(2) = 0.71 YSI; 0.75 TriOS) of cyanobacteria. However, the difference between cell densities determined by microscopy and measured by the YSI can be very large and has been associated to the variability of cell volume among cyanobacteria. This last observation makes the YSI a qualitative tool if a post-calibration is not done. The analysis of filtrated samples showed that dissolved phycocyanin (extracellular) may represent a significant fluorescence signal. No relationship could be established between the abundance, the total cyanobacterial biovolume or the in vivo fluorescence of phycocyanin and the concentrations of cyanotoxins (R(2) ≤ 0.22).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations95
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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