Mechanistic Insights Revealed by the Crystal Structure of a Histidine Kinase with Signal Transducer and Sensor Domains
Notice bibliographique
Résumé
Two-component systems (TCSs) are important for the adaptation and survival of bacteria and fungi under stress conditions. A TCS is often composed of a membrane-bound sensor histidine kinase (SK) and a response regulator (RR), which are relayed through sequential phosphorylation steps. However, the mechanism for how an SK is switched on in response to environmental stimuli remains obscure. Here, we report the crystal structure of a complete cytoplasmic portion of an SK, VicK from Streptococcus mutans. The overall structure of VicK is a long-rod dimer that anchors four connected domains: HAMP, Per-ARNT-SIM (PAS), DHp, and catalytic and ATP binding domain (CA). The HAMP, a signal transducer, and the PAS domain, major sensor, adopt canonical folds with dyad symmetry. In contrast, the dimer of the DHp and CA domains is asymmetric because of different helical bends in the DHp domain and spatial positions of the CA domains. Moreover, a conserved proline, which is adjacent to the phosphoryl acceptor histidine, contributes to helical bending, which is essential for the autokinase and phosphatase activities. Together, the elegant architecture of VicK with a signal transducer and sensor domain suggests a model where DHp helical bending and a CA swing movement are likely coordinated for autokinase activation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».