Bacterial Genetic Determinants of Non‐O157 STEC Outbreaks and Hemolytic‐Uremic Syndrome after Infection
Notice bibliographique
Résumé
Although O157:H7 Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) are the predominant cause of hemolytic-uremic syndrome (HUS) in the world, non-O157:H7 serotypes are a medically important cause of HUS that are underdetected by current diagnostic approaches. Because Shiga toxin is necessary but not sufficient to cause HUS, identifying the virulence determinants that predict severe disease after non-O157 STEC infection is of paramount importance. Disease caused by O157:H7 STEC has been associated with a 26-gene pathogenicity island known as O island (OI) 122. To assess the public-health significance of this pathogenicity island, we examined the association between OI122 genes and outbreaks and HUS after non-O157 STEC infection. We found that a subset of OI122 genes is independently associated with outbreaks and HUS after infection with non-O157 STEC. The presence of multiple virulence genes in non-O157 serotypes strengthened this association, which suggests that the additive effects of a variable repertoire of virulence genes contribute to disease severity. In vivo, Citrobacter rodentium mutants lacking outbreak- and HUS-associated genes were deficient for virulence in mice; in particular, nleB mutant bacteria were unable to cause mortality in mice. The present study shows that virulence genes associated epidemiologically with outbreaks and HUS after non-O157 STEC infection are pivotal to the initiation, progression, and outcome of in vivo disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».