MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2137836110 · doi:10.1016/j.jalz.2009.04.780

P4‐112: The sortilin‐related receptor (SORL1) influences variation in memory in late‐onset Alzheimer disease

2009· article· en· W2137836110 sur OpenAlexaff
Christiane Reitz, Joseph Lee, Rong Cheng, Ekaterina Rogaeva, Shinya Tokuhiro, Lorraine N. Clark, Peter St George‐Hyslop, Richard Mayeux

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBioinformatics and Genomic Networks
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismHaplotypeAlzheimer's diseaseRecallGeneticsBiologyDiseaseGenotypeMedicineInternal medicinePsychologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recent studies implicated the neuronal sortilin-related receptor gene SORL1 as a susceptibility gene for late-onset Alzheimer disease (AD). We explored whether variation in SORL1 is associated with memory performance using 2 independent datasets. We first examined the association between measures of cognitive function and the same 29 single nucleotide polymorphisms (SNPs) used in our earlier paper (Rogaeva et al, 2007) in 1,180 individuals from 228 families participating in the Caribbean Hispanic Family Study of Familial Alzheimer disease using family-based association analyses. Then we explored the association of the same 29 SNPs with memory performance in 425 Caribbean Hispanics (212 cases vs. 213 controls) from a multiethnic random sample of Medicare recipients ≥65 years and residing in northern Manhattan. In the family cohort, haplotypes at SNPs 1-4 (p=0.0008), 7-10 (p=0.05) and 14-18 (p=0.003) were significantly associated with measures of memory performance. In the epidemiological cohort, we replicated these findings by showing that haplotypes at SNPs 1-3 were significantly associated with total recall (p=0.02) and Benton recognition (p=0.04), haplotypes at SNPs 15-17 were associated with total recall (p=0.05) and Benton recognition (p=0.03), haplotypes at SNPs 21-23 were associated with total recall (p=0.05), delayed recall (p=0.02) and Benton recognition (p=0.03), and haplotypes at SNPs 27-29 were associated with total recall (p=0.02), delayed recall (p=0.0008) and Benton recognition (p=0.02). However, these SNPs that were significant for memory performance were not associated with abstract reasoning and language function. Genetic variation in SORL1 is specifically associated with memory function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,017

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAlzheimer s & Dementia→Même sujetBioinformatics and Genomic Networks→Travaux en français237 207→