Bioaccumulation of Amylose‐Like Glycans by <i>Helicobacter pylori</i>
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Helicobacter pylori cell surface is composed of lipopolysaccharides (LPSs) yielding structures homologous to mammalian Lewis O-chains blood group antigens. These structures are key mediators in the definition of host-microbial interactions and known to change their expression pattern in response to environmental pressure. AIMS: The present work is focused on the identification of new H. pylori cell-surface glycosides. Special attention is further devoted to provide insights on the impact of in vitro subcultivation on H. pylori cell-surface phenotypes. METHODS: Cell-surface glycans from H. pylori NCTC 11637 and two clinical isolates were recovered from the aqueous phase resulting from phenol:water extraction of intact bacteria. They were evaluated in relation to their sugars and glycosidic-linkages composition by CG-MS, size-exclusion chromatography, NMR, and Mass Spectrometry. H. pylori glycan profile was also monitored during subcultivation in vitro in agar and F12 liquid medium. RESULTS: All three studied strains produce LPS expressing Lewis epitopes and express bioaccumulate amylose-like glycans. Bioaccumulation of amylose was found to be enhanced with the subcultivation of the bacterium on agar medium and accompanied by a decrease in the expression of LPS O-chains. In contrast, during exponential growth in F12 liquid medium, an opposite behavior is observed, that is, there is an increase in the overall amount of LPS and decrease in amylose content. CONCLUSIONS: This work shows that under specific environmental conditions, H. pylori expresses a phase-variable cell-surface alpha-(1-->4)-glucose moiety.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».