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Enregistrement W2137899001 · doi:10.1091/mbc.e11-10-0857

Identification of a novel ADAMTS9/GON-1 function for protein transport from the ER to the Golgi

2012· article· en· W2137899001 sur OpenAlexfundno aff
Sawako Yoshina, Kenjiro Sakaki, Aki Yonezumi-Hayashi, Keiko Gengyo‐Ando, Hideshi Inoue, Yuichi Iino, Shohei Mitani

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology of the Cell · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCore Research for Evolutional Science and TechnologyInstitute of GeneticsNational Center for Research ResourcesNational Institutes of HealthJapan Science and Technology AgencyUniversity of Minnesota
Mots-clésBiologyGolgi apparatusIdentification (biology)Function (biology)Cell biologyTransport proteinComputational biologyEndoplasmic reticulumEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A disintegrin-like and metalloprotease with thrombospondin type I motif (ADAMTS9) is a member of the secreted metalloprotease family that is believed to digest extracellular matrix (ECM) proteins outside of cells. Its Caenorhabditis elegans orthologue, GON-1, is involved in ECM degradation and is required for gonad morphogenesis. ADAMTS9 and GON-1 have similar domain structures, and both have a unique C-terminal domain called the "GON domain," whose function remains unknown. Here we show that down-regulation of human ADAMTS9 and C. elegans GON-1 results in the inhibition of protein transport from the endoplasmic reticulum (ER) to the Golgi. This phenotype was rescued by the expression of the GON domain localizing in the ER in human cells and C. elegans. We propose a novel function of ADAMTS9 and GON-1 in the ER that promotes protein transport from the ER to the Golgi. This function is GON-domain dependent but protease activity independent.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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