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Enregistrement W2137907238 · doi:10.1111/j.1601-183x.2010.00648.x

Pleiotropic effects of the 11p13 locus on developmental verbal dyspraxia and EEG centrotemporal sharp waves

2010· article· en· W2137907238 sur OpenAlexafffund
Deb K. Pal, W. Li, Tara Clarke, Philip Lieberman, Lisa J. Strug

Notice bibliographique

RevueGenes Brain & Behavior · 2010
Typearticle
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueLanguage Development and Disorders
Établissements canadiensInstitute for Clinical Evaluative SciencesUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Human Genome Research InstituteNational Institutes of HealthNational Institute of Neurological Disorders and StrokeEpilepsy SocietyOntario Ministry of Research and InnovationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaEuropean CommissionNational Space Biomedical Research InstituteAmerican Epilepsy SocietyParents Against Childhood EpilepsyEpilepsy Foundation
Mots-clésProbandGenetic linkageLocus (genetics)PsychologyAudiologyGeneticsMedicineBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We recently showed genomewide linkage of centrotemporal sharp waves (CTS) in classic Rolandic epilepsy (RE) families to chromosome 11p13, and fine-mapped this locus to variants in the ELP4 gene. Speech sound disorder (SSD) is a common comorbidity in RE subjects, of unknown etiology, which co-aggregates in family members in a manner that could hypothetically be explained by shared underlying genetic risk with CTS. Furthermore, the neural mechanism of SSD is unknown, although individuals with rare, Mendelian forms of RE are described with severe verbal and oromotor apraxia. We therefore first performed genomewide linkage analysis for SSD, operationally defined as clinical history consistent with ICD-10 speech articulation disorder, in 38 families singly ascertained through a proband with RE. We tested the hypothesis of shared genetic risk with CTS at the 11p13 locus. In the second part of the study we used computerized acoustic analysis of recorded speech to test the hypothesis of dyspraxia as a mechanism for SSD in a smaller subset of RE probands and relatives. In two-point and multipoint LOD score analysis, we found that evidence for linkage to the 11p13 locus increased substantially when the phenotype was broadened from CTS to CTS/SSD. In multipoint analysis, the LOD score rose by 3.2 to HLOD 7.54 at D11S914 for CTS/SSD, the same marker at which multipoint linkage maximized for CTS alone. Non-parametric, affected-only methods in a sub-set of the data provide further confirmatory evidence for pleiotropy. In acoustic analysis there were voice-onset time abnormalities in 10/18 RE probands, 8/16 siblings and 5/15 parents, providing evidence of breakdown in the spatial/temporal properties of speech articulation consistent with a dyspraxic mechanism. The results from genetic and physiological studies suggest a pleiotropic role for the 11p13 locus in the development of both SSD and CTS, and also indicate a dyspraxic mechanism for the SSD linked to 11p13. Taken together, these data strongly support a neurodevelopmental origin for classic RE.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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