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Enregistrement W2137987108 · doi:10.1002/ajmg.a.31244

Genotype–phenotype correlations in mapped split hand foot malformation (SHFM) patients

2006· article· en· W2137987108 sur OpenAlexaff
Alison M. Elliott, Jane Evans

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital limb and hand anomalies
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEctrodactylySyndactylyPenetrancePolydactylyGeneticsExpressivityPhenotypeBiologyEctodermal dysplasiaGenotypeLimb developmentGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Split hand foot malformation (SHFM) also known as central ray deficiency, ectrodactyly and cleft hand/foot, is one of the most complex of limb malformations. SHFM can occur as an isolated malformation or in association with other malformations, as in the ectrodactyly-ectodermal dysplasia-clefting (EEC) syndrome and other autosomal dominant conditions with long bone involvement, all showing variable expressivity and reduced penetrance. The deficiency in SHFM patients can also be accompanied by other distal limb anomalies including polydactyly and/or syndactyly. This variability causes the phenotypic classification of SHFM to be far from straightforward and genetic heterogeneity, with at least five loci identified to date, further complicates management of affected patients and their families. Although genotypic-phenotypic correlations have been proposed at the molecular level for SHFM4 patients who have mutations in the P63 gene, phenotypic correlations at the chromosomal level have not been thoroughly documented. Using descriptive epidemiology, Chi square and discriminant function analyses, our laboratory has identified phenotypic patterns associated with the mapped genetic SHFM loci. These findings can assist in classification, provide insight into responsible developmental genes and assist in directing mapping efforts and targeted genetic testing, resulting in more accurate information for family members in the clinical setting. Comparison with relevant animal models is discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,518
Score d'incertitude au seuil0,390

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations82
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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