Antitumor compounds from Streptomyces sp. KML-2, isolated from Khewra salt mines, Pakistan
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Actinomycetes are gram positive bacteria with high G + C content in their DNA and are capable of producing variety of secondary metabolites. Many of these metabolites possess different biological activities and have the potential to be developed as therapeutic agents. The aim of the present study was to screen actinomycetes inhabiting halophilic environment such as Khewra salt mines present in Pakistan for cytotoxic and antitumor compounds. RESULTS: An actiomycetes strain designated as Streptomyces sp. KML-2 was isolated from a saline soil of Khewra salt mines, Pakistan. The strain Streptomyces sp. KML-2 showed 84 % cytotoxic activity against larvae of Artemia salina. In the screening phase, the strain exhibited significant antitumor activity with IC50 values of 12, 48 and 56 µg/ml against Hela, MDBK and Vero cell lines, respectively. After that extract from 20 l fermentation was used to purify secondary metabolites by several chromatographic techniques. Structure elucidation of isolated compounds revealed that it is highly stable producer of Chromomycin SA (1) and 1-(1H-indol-3-yl)-propane-1,2,3-triol (2). Both of the isolated compounds showed significant antitumor activity against Hela and MCF-7 cancer cell lines (IC50 values 8.9 and 7.8 µg/ml against Hela; 12.6 and 0.97 µg/ml against MCF-7, respectively). The 16S rRNA gene sequence (1437 bp) of the strain confirm its identity (99 %) with Streptomyces griseus. CONCLUSIONS: From this research work we were successful in isolating two potent antitumor compounds, Chromomycin SA and 1-(1H-indol-3-yl)-propane-1,2,3-triol from Streptomyces KML-2 strain, isolated from Khewra salt mine. As such this is the second report which confirms that S. griseus can produce Chromomycin SA without introducing any mutagenesis in its biosynthesizing gene cluster and isolated indole derivative is being reported first time from any member of actinomycetes group with having novel antitumor activity against Hela and MCF-7 cells. Nucleotide sequences: Nucleotide sequence data reported are available in the GenBank database under the accession number: GenBank KJ009562.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».