Histidine is a source of the antioxidant, α-ketoglutarate, in Pseudomonas fluorescens challenged by oxidative stress
Notice bibliographique
Résumé
The role of alpha-ketoglutarate (KG) in the detoxification of reactive oxygen species (ROS) has only recently begun to be appreciated. This ketoacid neutralizes ROS in an NADPH-independent manner with the concomitant formation of succinate and CO(2). To further probe this intriguing attribute of KG in living systems, we have evaluated the significance of histidine metabolism in the model organism, Pseudomonas fluorescens, challenged by hydrogen peroxide (H(2)O(2)). Here, we show that this amino acid does contribute to KG homeostasis and appears to be earmarked for the production of KG during oxidative stress. Both the NAD- and the NADP-dependent glutamate dehydrogenases were upregulated in the stressed cells despite the sharp decline in the activities of numerous enzymes mediating the tricarboxylic acid cycle and oxidative phosphorylation. Enzymes such as isocitrate dehydrogenase-NAD dependent, succinate dehydrogenase, alpha-ketoglutarate dehydrogenase, Complex I, and Complex IV were severely affected in the P. fluorescens grown in the presence of H(2)O(2). Studies with fluorocitrate, a potent inhibitor of citrate metabolism, clearly revealed that histidine was preferentially utilized in the production of KG in the H(2)O(2)-challenged cells. Regulation experiments also helped confirm that the metabolic reprogramming, resulting in the enhanced production of KG was induced by H(2)O(2) stress. These data further establish the pivotal role that KG plays in antioxidative defense.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».