The Pel and Psl polysaccharides provide <i>Pseudomonas aeruginosa</i> structural redundancy within the biofilm matrix
Notice bibliographique
Résumé
Extracellular polysaccharides comprise a major component of the biofilm matrix. Many species that are adept at biofilm formation have the capacity to produce multiple types of polysaccharides. Pseudomonas aeruginosa produces at least three extracellular polysaccharides, alginate, Pel and Psl, that have been implicated in biofilm development. Non-mucoid strains can use either Pel or Psl as the primary matrix structural polysaccharide. In this study, we evaluated a range of clinical and environmental P.aeruginosa isolates for their dependence on Pel and Psl for biofilm development. Mutational analysis demonstrates that Psl plays an important role in surface attachment for most isolates. However, there was significant strain-to-strain variability in the contribution of Pel and Psl to mature biofilm structure. This analysis led us to propose four classes of strains based upon their Pel and Psl functional and expression profiles. Our data also suggest that Pel and Psl can serve redundant functions as structural scaffolds in mature biofilms. We propose that redundancy could help preserve the capacity to produce a biofilm when exopolysaccharide genes are subjected to mutation. To test this, we used PAO1, a common lab strain that primarily utilizes Psl in the matrix. As expected, a psl mutant strain initially produced a poor biofilm. After extended cultivation, we demonstrate that this strain acquired mutations that upregulated expression of the Pel polysaccharide, demonstrating the utility of having a redundant scaffold exopolysaccharide. Collectively, our studies revealed both unique and redundant roles for two distinct biofilm exopolysaccharides.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».