Resistance gene analogues are clustered on chromosome 3 of sugar beet and cosegregate with QTL for rhizomania resistance
Notice bibliographique
Résumé
Worldwide, rhizomania is the most important disease of sugar beet. The only way to control this disease is to use resistant varieties. Four full-length resistance gene analogues (RGAs) from sugar beet (cZR-1, cZR-3, cZR-7, and cZR-9) were used in this study. Their predicted polypeptides carry typical nucleotide-binding sites (NBSs) and leucin-rich repeat (LRR) regions, and share high homology to various plant virus resistance genes. Their corresponding alleles were cloned and sequenced from a rhizomania resistant genotype. The 4 RGAs were mapped as molecular markers, using sequence-specific primers to determine their linkage to the rhizomania resistance locus Rz1 in a population segregating for rhizomania resistance. One cZR-3 allele, named Rz-C, together with 5 other molecular markers, mapped to the Rz1 locus on chromosome 3 and cosegregated with quantitative trait loci for rhizomania resistance. After screening a bacterial artificial chromosome (BAC) library, 25 cZR-3-positive BACs were identified. Of these, 15 mapped within an interval of approximately 14 cM on chromosome 3, in clusters close to the Rz1 locus. Rz-C differentiates between susceptible and resistant beet varieties, and its transcripts could be detected in all rhizomania resistant varieties investigated. The potential of this RGA marker for cloning of rhizomania resistance genes is discussed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».