Expression of a New Operon from <i>Bacillus subtilis</i> , <i>ykzB-ykoL</i> , under the Control of the TnrA and PhoP-PhoR Global Regulators
Notice bibliographique
Résumé
The ykzB and ykoL genes encode two peptides, of 51 and 60 amino acids, the functions of which are unknown. The ykzB and tnrA genes are contiguous and transcribed divergently. Expression of ykzB and ykoL is induced by glutamate and is under the control of the TnrA global regulator of nitrogen utilization. TnrA regulated its own synthesis in glutamate minimal medium. Two DNA sequences (TnrAB1 and TnrAB2) homologous to the TnrA binding site are present in the region between tnrA and ykzB. Deletion mapping indicated that the TnrAB2 binding site was involved in activation of the ykzB promoter. In addition, transcription of tnrA depends on the presence of the TnrAB1 binding site. The ykzB and ykoL genes are probably in the same transcriptional unit. A single promoter involved in transcription in the presence of glutamate was mapped by primer extension. ykoL expression was induced by phosphate limitation and depended on the PhoP-PhoR two-component regulatory system. Its promoter was mapped to the region between ykoL and ykzB. Four boxes similar to the PhoP binding site are present upstream from the ykoL promoter. These boxes are probably recognized by PhoP approximately P during the activation of transcription in phosphate limitation conditions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».