Visualizing Dynamic E2F-Mediated Repression In Vivo
Notice bibliographique
Résumé
Although many E2F target genes have been identified recently, very little is known about how any single E2F site controls the expression of an E2F target gene in vivo. To test the requirement for a single E2F site in vivo and to learn how E2F-mediated repression is regulated during development and tumorigenesis, we have constructed a novel series of wild-type and mutant Rb promoter-LacZ transgenic reporter lines that allow us to visualize the activity of a crucial E2F target in vivo, the retinoblastoma tumor suppressor gene (Rb). Two mutant Rb promoter-LacZ constructs were used to evaluate the importance of a single E2F site or a nearby activator (Sp1/Ets) site that is found mutated in low-penetrance retinoblastomas. The activity of the wild-type Rb promoter is dynamic, varying spatially and temporally within the developing nervous system. While loss of the activator site silences the Rb promoter, loss of the E2F site stimulates its activity in the neocortex, retina, and trigeminal ganglion. Surprisingly, E2F-mediated repression of Rb does not act globally or in a static manner but, instead, is a highly dynamic process in vivo. Using neocortical extracts, we detected GA-binding protein alpha (GABPalpha, an Ets family member) bound to the activator site and both E2F1 and E2F4 bound to the repressor site of the Rb promoter in vitro. Additionally, we detected binding of both E2F1 and E2F4 to the Rb promoter in vivo using chromatin immunoprecipitation analysis on embryonic day 13.5 brain. Unexpectedly, we detect no evidence for Rb promoter autoregulation in neuroendocrine tumors from Rb+/-; RbP-LacZ mice that undergo loss of heterozygosity at the Rb locus, in contrast to the situation in human retinoblastomas where high RB mRNA levels are found. In summary, this study provides the first demonstration that loss of an E2F site is critical for target gene repression in vivo and underscores the complexity of the Rb and E2F family network in vivo.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».