A tale of two haplotype groups: evaluating the New World <i>Junonia</i> ring species hypothesis using the distribution of divergent <i> <scp>COI</scp> </i> haplotypes
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The New World Junonia butterflies are a possible ring species with a circum‐Caribbean distribution. Previous reports suggest a steady transition between North and South American forms in Mesoamerica, but in Cuba the forms were thought to co‐exist without interbreeding representing the overlapping ends of the ring. Three criteria establish the existence of a ring species: a ring‐shaped geographic distribution, gene flow among intervening forms and genetic isolation in the region of range overlap. We evaluated mitochondrial cytochrome oxidase I haplotypes in Junonia from nine species in the Western Hemisphere to test the Junonia ring species hypothesis. Junonia species are generally not monophyletic with respect to COI haplotypes, which are shared across species. However, two major COI haplotype groups exist. Group A predominates in South America, and Group B predominates in North and Central America. Therefore, COI haplotypes can be used to assess the degree of genetic influence a population receives from each continent. Junonia shows a ring‐shaped distribution around the Caribbean, and evidence is consistent with gene flow among forms of Junonia, including those from Mesoamerica. However, we detected no discontinuity in gene flow in Cuba or elsewhere in the Caribbean consistent with genetic isolation in the region of overlap. Although sampling is still very limited in the critical region, the only remaining possibility for a circum‐Caribbean discontinuity in gene flow is at the Isthmus of Panama, where there may be a transition from 98% Group B haplotypes in Costa Rica to 85–100% Group A haplotypes in South America.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».