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Enregistrement W2138573212 · doi:10.1002/wsb.230

A technique to discriminate <i>Canis</i> mitochondrial DNA of New World and Old World origins using specific primers

2012· article· en· W2138573212 sur OpenAlexaffabout
Nathalie Tessier, Astrid Vik Strønen, François‐Joseph Lapointe

Notice bibliographique

RevueWildlife Society Bulletin · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueWildlife Ecology and Conservation
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMitochondrial DNACanisBiologyEvolutionary biologyZoologyGeographyGeneticsEcologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Genetic markers play an important role in elucidating taxonomic uncertainties for a wide range of organisms. We present a set of specific primers to distinguish between Canis mitochondrial DNA (mtDNA) of New World (North American) and Old World (Eurasian) origin using the ATP‐8 region and gel electrophoresis. We amplified mtDNA from Old World (gray wolves [ Canis lupus L., 1758]) and New World canids (coyotes [ C. latrans Say, 1823] and eastern wolves [ C. lycaon Schreber, 1775 or C. lupus lycaon ]) collected during 2003–2009 in Québec, Canada, using a multiplexed primer triplet. The results showed a standard band of 150 base pairs (bp) for New World and Old World mtDNA. In addition, Old World mtDNA displayed a second band of 100 bp. The range extent of wolves with New World mtDNA has important implications for canid conservation. The new method can assist conservation managers with rapid and cost‐effective screening to monitor 1) the distribution and abundance of wolves with New World and Old World mtDNA, and 2) wolf–coyote hybridization, when used in combination with morphological information and other nuclear markers. © 2012 The Wildlife Society.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,041

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission2
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