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Enregistrement W2138577861 · doi:10.1111/j.1365-294x.2011.05366.x

Population structure and migration pattern of a conifer pathogen,<i>Grosmannia clavigera</i>, as influenced by its symbiont, the mountain pine beetle

2011· article· en· W2138577861 sur OpenAlexafffundabout
Clement K. M. Tsui, Amanda D. Roe, Yousry A. El‐Kassaby, Adrianne V. Rice, Sepideh Massoumi Alamouti, Felix A. H. Sperling, Janice E. K. Cooke, Jörg Bohlmann, Richard C. Hamelin

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueForest Insect Ecology and Management
Établissements canadiensNatural Resources CanadaCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of AlbertaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesGenome AlbertaGenome Canada
Mots-clésBiologyMountain pine beetleRange (aeronautics)PopulationEcologyGenetic structureGenetic diversityPopulation geneticsDendroctonusPinus contortaZoologyGenetic variationBark beetle

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We investigated the population structure of Grosmannia clavigera (Gc), a fungal symbiont of the mountain pine beetle (MPB) that plays a crucial role in the establishment and reproductive success of this pathogen. This insect-fungal complex has destroyed over 16 million ha of lodgepole pine forests in Canada, the largest MPB epidemic in recorded history. During this current epidemic, MPB has expanded its range beyond historically recorded boundaries, both northward and eastward, and has now reached the jack pine of Alberta, potentially threatening the Canadian boreal forest. To better understand the dynamics between the beetle and its fungal symbiont, we sampled 19 populations in western North America and genotyped individuals from these populations with eight microsatellite markers. The fungus displayed high haplotype diversity, with over 250 unique haplotypes observed in 335 single spore isolates. Linkage equilibria in 13 of the 19 populations suggested that the fungus reproduces sexually. Bayesian clustering and distance analyses identified four genetic clusters that corresponded to four major geographical regions, which suggested that the epidemic arose from multiple geographical sources. A genetic cluster north of the Rocky Mountains, where the MPB has recently become established, experienced a population bottleneck, probably as a result of the recent range expansion. The two genetic clusters located north and west of the Rocky Mountains contained many fungal isolates admixed from all populations, possibly due to the massive movement of MPB during the epidemic. The general agreement in north-south differentiation of MPB and G. clavigera populations points to the fungal pathogen's dependence on the movement of its insect vector. In addition, the patterns of diversity and the individual assignment tests of the fungal associate suggest that migration across the Rocky Mountains occurred via a northeastern corridor, in accordance with meteorological patterns and observation of MPB movement data. Our results highlight the potential of this pathogen for both expansion and sexual reproduction, and also identify some possible barriers to gene flow. Understanding the ecological and evolutionary dynamics of this fungus-beetle association is important for the modelling and prediction of MPB epidemics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,375
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations49
Publié2011
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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