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Enregistrement W2138597400 · doi:10.3324/haematol.2010.025767

The pre-B-cell receptor associated protein VpreB3 is a useful diagnostic marker for identifying c-MYC translocated lymphomas

2010· article· en· W2138597400 sur OpenAlexafffund
Scott J. Rodig, Jeffery L. Kutok, Jennifer C. Paterson, Hiroaki Nitta, Wenqing Zhang, Bjoern Chapuy, Lynnette K Tumwine, Santiago Montes‐Moreno, Claudio Agostinelli, Nathalie A. Johnson, Susana Ben‐Neriah, Pedro Farinha, Margaret A. Shipp, Miguel Á. Piris, Thomas M. Grogan, S. Pileri, Randy D. Gascoyne, Teresa Marafioti

Notice bibliographique

RevueHaematologica · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueT-cell and B-cell Immunology
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesBC Cancer Agency
Mots-clésLymphomaB cellGerminal centerBiologyCancer researchChromosomal translocationImmunoglobulin light chainDiffuse large B-cell lymphomaPathologyHaematopoiesisAntibodyImmunologyMedicineStem cellGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: During B-cell development, precursor B cells transiently express the pre-B-cell receptor composed of μ heavy chain complexed with VpreB and λ5 surrogate light chain polypeptides. Recent profiling studies unexpectedly revealed abundant transcripts of one member of the VpreB family, VpreB3, in a subset of mature B cells and Burkitt lymphoma. DESIGN AND METHODS: Here we used a novel antibody to investigate the normal expression pattern of VpreB3 protein in human hematopoietic and lymphoid tissues, and to determine whether VpreB3 could serve as a useful diagnostic biomarker for select B-cell lymphomas. RESULTS: We found that VpreB3 protein is normally expressed by precursor B cells in bone marrow and by a subset of normal germinal center B cells in secondary lymphoid organs. Among lymphoid malignancies, we found an association between VpreB3 expression and B-cell tumors with c-MYC abnormalities. VpreB3 was highly expressed in all cases of Burkitt lymphoma, whether of endemic or sporadic origin (44/44 cases, 100%), all cases of B-cell lymphoma, unclassifiable, with features intermediate between diffuse large B-cell lymphoma and Burkitt lymphoma (5/5 cases, 100%), and the majority of diffuse large B-cell lymphomas harboring a c-MYC translocation (15/18 cases, 83%). The expression of VpreB3 in diffuse large B-cell lymphomas without a c-MYC translocation was associated with c-MYC polysomy in 25/75 cases (33%) but only rarely observed in diffuse large B-cell lymphomas lacking a c-MYC abnormality (9/98 cases, 9%). CONCLUSIONS: We conclude that for B-cell tumors with features suggesting a possible c-MYC translocation, such as intermediate to large cell size and high proliferation rate, the presence of VpreB3 should prompt subsequent confirmatory genetic testing, whereas the absence of VpreB3 is virtually always associated with wild-type c-MYC alleles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,153
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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